Zgodnie z ustawą o odpadach na przedsiębiorcy ciąży obowiązek odzysku i zagospodarowania powstających w zakładzie odpadów niebezpiecznych oraz odpadów innych niż niebezpieczne. LW Bogdanka SA prowadzi zagospodarowanie odpadów poprzemysłowych i przekazuje jednostkom uprawnionym odpady, które nadają się do wykorzystania (np. drewno, oleje przepracowane, złom, ścinki taśm przenośnikowych) lub unieszkodliwiania (np. zużyte źródła światła, opakowania po klejach, farbach).

Zgodnie z ustawą o odpadach wydobywczych działania kopalni ukierunkowane są na maksymalny odzysk i wykorzystanie odpadów wydobywczych (górniczych).

Odzysk odpadów polega na ich wykorzystaniu w procesie rekultywacji trenów zdegradowanych (różnego rodzaju wyrobisk poeksploatacyjnych) , remontach dróg lokalnych oraz przy produkcji materiałów budowlanych w Cementowni "Ożarów" W ten sposób gospodarczo wykorzystywanych jest ok. 40-50% uzyskanych odpadów górniczych.

Pozostała cześć odpadów wydobywczych trafia na obiekt unieszkodliwiania odpadów wydobywczych. Obecnie obiekt unieszkodliwiania odpadów wydobywczych zajmuje powierzchnię ok. 84,2 ha (docelowo ok.95 ha) i ma wysokość względną ok. 58 m(docelowo -80 m wysokości względnej). Stopniowo, w miarę udostępniania skarp, prowadzona jest bieżąca rekultywacja w kierunku darniowo-zadrzewieniowym.

Kopalnia prowadzi działania w celu rozbudowy obiektu unieszkodliwiania odpadów wydobywczych, które przewidują powiększenie obiektu w kierunku wschodnim i południowych i zagospodarowanie w kierunku sportowo – rekreacyjnym.